Mezuniyete sadece on beş gün kala, hükümetin Kunugigaoka Ortaokulu üzerindeki askeri ve dijital gözetimi en üst seviyeye çıkar. 3-E sınıfının dışlanmış öğrencileri, Mach 20 hızında hareket eden uzaylı öğretmenleri Koro-sensei'yi öldürme göreviyle son kez baş başa kalırken, dersler başlamadan önce sınıfta derin bir nostalji rüzgarı eser. Geçmişte yaşadıkları komik havuz maceralarını, öğretmenlerin açıklarını yakaladıkları anları ve birlikte ne kadar büyüdüklerini hatırlayan öğrenciler, yaklaşan kaçınılmaz sonla yüzleşmeye çalışırlar.